Шунта Могами обожает игру Battle Spirits. Однажды луч света от карты Battle Spirits переносит его в Мир Духов, место рождения всех Battle Spirits. Там он встречает девушку по имени Это, которая говорит, что призвала его остановить воскрешённого Злого Бог‑Короля от разрушения Мира Духов, божество, которое когда-то задумало его гибель до того, как было побеждено и запечатано. Вместе с уверенным в себе пользователем зелёной колоды Юко Альбатросой, который тоже прибыл из другого измерения, Шунта отправляется в поисках двенадцати Бог‑Королей, чья совокупная мощь изначально запечатала Злого Бог‑Короля в надежде восстановить баланс их мира.
