В ноябре 1998 года в недавно построенном жилом комплексе Огава, расположенном в центре города Мифуне, произошло двойное убийство. Убийца, Томое Энджо, сбежал в панике. К его удивлению полиция не преследовала его, а инцидент остался без внимания прессы. После того как Шики Рёги защитила Томое от бандитов, она разрешила ему остаться в своём доме как убежище. Однако через несколько дней Томое потрясён, когда узнаёт, что его мать жива, несмотря на то, что он считал, что убил её.
В то же время Микия Кокуто следит за тем, что его соратник Тоуко Аозаки получил информацию о убийстве в этом характерном жилом здании. Погружаясь глубже в дело, Микия заинтересовался Томое. Выбрав дальнейшее расследование, он вскоре раскрывает ужасающую реальность зловещего комплекса Огава.
Пятая часть кинематографической саги Kara no Kyoukai, Mujun Rasen, сочетает плотно сплетённый мистика с знакомыми мотивами и персонажами, чтобы предложить мрачную, заставляющую задуматься историю. Она приглашает зрителей задать вопросы о морали и судьбе в лабиринте тайн.