マリンは、明るさを放ち、養育家庭で楽しく過ごす普通の中学生です。彼女の日常は、奇妙な蜃気楼が空全体に架かる瞬間に崩壊します。ブリガドーンと呼ばれる天体から、モノマキアという致命的なアンドロイドが地球に降り注ぎ、若きマリンを狩り始めます。逃走中に彼女は神社の中で青いビンを見つけ、そこからメラン・ブルーという剣付き銃を持ち、保護を誓うエイリアンが現れます。二人は家族の混乱、学校での差別、法執行機関の監視を乗り越えながら地球を守る使命に挑み、最終的にはマリンの過去とメランの謎めいた目的を明らかにし、互いを信頼することを学びます。物語は1969年の日本で、活気ある仲間と敵対者たちが絶え間ない危険に立ち向かい、東京のネオン輝く夜に壊れない絆を築く様子を描いています。
