17歳の日本人少年が、静かな渓谷に住む悪魔たちを知るために田舎へやって来る。
主人公のユ・ナルカミが叔父の家と新しい学校に慣れようもなく、静かな町イナバで連続殺人事件が発生し、遺体は文字通り電線やアンテナに吊るされていた。
雨の夜に自分の運命の相手か、未来の被害者を見られるという『真夜中のチャンネル』に関する噂が広まった。
そしてもちろん、クラスメートの中にはヤンキーのヨスケ・ハナムラと、ハイパーアクティブなティエ・サトノカがいて、彼らはすぐに貧しいナルカミを大きなトラブルへと巻き込んだ。
実は、連続殺人事件の謎は、人間集団無意識が生み出す平行テレビ世界で探さなければならないことが判明した。
そこで生き残るには、自分の影（シェード）を倒し、自己の暗い側面を理解し受け入れることが必要で、その時に人格と意思をペルソナという精神的な化身として具現化できる。
ペルソナの力は、どれだけ人が善良で真実を語り、人々のために生きているかによって決まる。
徐々に、仲間を集めて「自分の仲間を守る」覚悟のある真面目なチームを結成し、主人公は人類そのものに脅威となる可能性のある謎を解明しつつある。
すべてのミステリーにもかかわらず、アニメのメッセージはシンプルだ。尊厳を持って生き、自分自身を救えば、周りの人々も救われる。
