「放課後のプレアデス」の世界では、空は本当に無限に広がっている。信頼できる望遠鏡を手にした鈴羽は、その晩の壮観な流星群を目撃するために学校の天文室へ向かう。きらめく星々のカノピーではなく、彼女を待っていたのは予想外の光景だった。天文台の扉の向こうに広がるのは、クリスタルのように澄んだ噴水と月光に輝く長い赤髪の謎めいた青年がいる贅沢な庭園だった。
その庭はまるで蜃気楼のようにほぼ瞬時に消えてしまう。残されたものは、奇妙で弾力のあるブロブ生物だけで、彼女を別の輝くポータルへと誘う。中に入ると、魔法使いのような衣装をまとった少女たちが円陣を組んでいる。次々と真実が明らかになる：隣にいた少女は幼馴染の青井で、ブロブは実際にはプレアデス種族の宇宙人で、故郷へ帰りたがっている；そして鈴羽はその存在に選ばれ、彼らの仲間になるよう命じられている。
鈴羽の生涯にわたる宇宙への夢は、狂ったような幻想的な形でついに現実となる。新たな仲間とともに、彼女はプレアデス宇宙船エンジンの散らばった部品を探し、宇宙人を星々を越えて帰路へと導く旅に出る。しかし、他の勢力も同じ部品を追い求めており、その理由は誰にもわからない。
