エバーグリーンの領域にある要塞から、5つの危険な「種」が盗まれ、地球へ運ばれた。王室の作戦員である夏樹は、それらを取り戻すために派遣された。しかし、彼一人では達成できず、「唯一の協力者」である中学生の千早を呼び出す。彼女は夏樹の助けを借りて、魔法戦士カーミンに変身し、種によって奴隷化された人々を救出する。多くの謎が残る――千早の母親がこの秘密作戦についてすべてを知っているように見える理由、彼女が生まれる前に亡くなったとされる父親を覚えている理由、そして彼女が訪れたことのないエバーグリーンを想像する理由、そして運命を永遠に結びつける隠された真実。
