やっとだ！熱望する夏休みの前日の最後の授業日。14歳のいちかと彼女の友達は教室を掃除し、その後数週間学校を忘れることができる。彼女たちは夏を目の前に見ながらほこりを拭き、いちかは大きな汚れた鏡を磨く。彼女の努力のおかげで、古い物はすぐに新しく輝き始める。掃除人が自分の映像を眺めていると、鏡に緑髪の少女が映り、驚きながらいちかを見つめる。いちかは振り向くが、誰もいない！恐怖の叫びに誘われて友達は助けを求め、鏡の秘密について恐ろしい噂を楽しげに語る：「時々、完全に正常ではない人は存在しない者を鏡で見ることがある。」クラスメートたちは恐れたいちかを説得しようとする。ベルが夏休みの開始を告げると、恐怖はすぐに忘れ去られる。夕方、いちかは失望して携帯電話をなくしたことに気付く。そこには、二つの銀片と12個の小石でできたブレスレットが付いていた。かわいいセイからプレゼントされたものだ。携帯電話が置かれる唯一の場所は、奇妙な鏡のある教室だ。薄暮にいちかは一人で学校へ戻るが、携帯電話は鏡の中にあるようで手に入らない。そんなとき、運命は驚くべき転換を遂げる：再び謎めいた少女が現れ、自然の精霊マナツと名乗る。彼女はいちかに取引を提案する：少女が同意すれば、マナツは光り輝く光に包まれながら鏡を離れる。彼女が携帯電話を返すと、自然の精霊は少女に学校のノートを渡す。これがマナツが求める借り物の第一部で、いちかは夏休みについてエッセイを書く必要がある。さらに、「妖精」は夏休み中に少女の家族と一緒に暮らしたいと言う。この条件は、いちかの親が驚くほど簡単に受け入れる。唯一彼女を悩ませるのは、元々透明だったブレスレットの小石が色とりどりになったことで、彼女は恋人とその兄であるカユ（両方とも彼女の家庭教師）に見られないようにできないことだ。しかしマナツは彼女の不安を共有せず、むしろ石の秘密について誇り高く語る。彼女の助けを借りて、いちかは12回魔法少女に変身できる。各石で彼女は神や自然の精霊の一人の服と力を得る。まず彼女は太陽の魂に変身する...
