晴れた、太陽が輝く静かな日に、兄妹のヌナリとレルーシュ・ランペロージは、一輪の木の下でくつろぐために立ち止まります。
ヌナリが物語を求めると、レルーシュは彼女への献身を貫きながら、独創的にジアスの力を使い、限界を打ち破って最も魅力的な物語を届けます。
樹冠の下で一人目覚めた、かつて盲目だったヌナリは視力を取り戻し、すぐに六騎士のアニャ・アルストレイムを思わせる奇妙なウサギに気づきます。
その生き物を見た瞬間、ヌナリは穴に転げ込み、鮮やかなワンダーランドへと運ばれます。
レルーシュ自身が語る『コードギアス：反逆のレルーシュ – ワンダーランドのヌナリ』は、家へ帰る道を探す旅するヌナリの物語であり、旅路でさまざまな明るく親しみやすい人物に出会い、輝く星が瞬く穏やかな明るい日の出の中で忘れられない冒険を描きます。
