一ノ瀬 はじめの日常は、J.J.ロビンソンという神のような存在が彼女に『NOTE』と名付けられた小さな書物を渡すことで予期せぬ転換点に立つ。この本は彼女をタチカワ市の有名な守護者、ガッチャマンの一員に変える道具だ。組織を隠し通す必要があると強調したガッチャマンの仲間、タチバナ スガネがはじめを彼らの本部へ案内する。そこでは、パンダ型の宇宙人リーダー・パイマンが、人類を脅かす異星の脅威を根絶するという使命について説明する。これら存在的な危険は『MESS』と呼ばれ、増すほどに脅威が大きくなり、接触したものを全て破壊する。今、ガッチャマンと新たなメンバーは、世界的混乱が起こる前にそれらを止める責任を負っている。