埼玉国立大学、日本の科学人材育成の鍛冶場。
二人の大学院生、ユキムラ・シンヤとアヤメ・ヒムロはある晴れた瞬間に、互いにただの友人や研究上のライバル以上の存在であることを悟り、愛を告白する。
しかし、個人的な関係の経験が全くなく、骨まで科学者である彼らは告白直後にこう問う。『本当にお互いを愛しているのか、そしてもしそうなら、それを科学的方法で証明できるのだろうか?』
こうして、二人の好奇心旺盛な頭脳が、特定の二人の間に真実の愛を表す方程式を作ろうとする探究の物語が始まる。彼らは徐々に同僚や研究室全体を巻き込んでいく。