Небесные Записи повествуют о присутствии Серафимов, класса небесных существ, которые даруют благословения человечеству и в ответ принимают от него молитвы. Тем, которым даровано умение общаться с этими духами, называют Пастухов. Они прославлены как спасители за их быстрые вмешательства во время кризисов, но и боятся из‑за своей мощи; Пастухи вплетены в народную мифологию вместе со Серафимами в летопись древней мифологии вечного почитания.
Сори, молодой смертный, вырос в полном согласии с Серафимами в деревне Элизии. Привлечённый легендами Небесных Записей, он отправляется в близлежащие руины вместе с Миклео — своим детским союзником-серафимом, чтобы раскрыть древнюю связь между человечеством и Серафимами в шёпоте забытых эпох.
К сожалению, пара оказывается запертой в тенистых уголках древнего места во время своих исследований. В поиске выхода они встречают загадочную девушку, молящуюся о помощи Пастуха, чтобы спасти мир, качающийся на краю поглощающей тьмы. Хотя Миклео предостерегает от взаимодействия с другими смертными, Сори решает помочь юной девушке, неосознанно приближаясь к видению гармоничного единства между людьми и Серафимами в сумерках судьбы и надежды.
