Сотни лет спустя двадцатого века флора и фауна Земли были разрушены ядерной и биологической войнами. Планета стала сильно загрязнённой, разрушаясь в пустоши; большинство растительного и животного мира погибло от вымирания. Человечество подошло к "Большой Шести", шестому глобальному кризису массового вымирания. Чтобы сохранить исчезающие виды, люди воздвигли небесные города и перенесли в них оставшуюся флору и фауну. Их город, чудо стекла и стали, плавал над разбитыми континентами. На протяжении бесчисленных поколений эти существа адаптировались в этих изолированных средах; благодаря инженерному генетическому рекомбинации они получили речь, ходили прямо и создали самодостаточное общество. Жители больше не задумывались о земле под ними. Однажды одно семя дрейфовало в одну из этих воздушных мегаполисов, и молодые Kui, Hiruma и Root нашли его. Привлечённые любопытством увидеть за пределами своего возвышенного царства, они решили отправиться в внешний мир, не осознавая, что ступив на землю, они сделают возвращение невозможным. Они никогда не видели края неба, ни слышали о реках или горах. Прибытие семени вызвало тихое восстание в их сердцах.