Когда Вторая мировая война приближалась к завершению в 1945 году, Япония пережила обширные разрушения от воздушных налетов США, которые уничтожили город за городом. Гробница светлячков повествует о Сейта и его сестре Сетсуко — двух японских детях, чья жизнь разрушена непрекращающимся конфликтом. Они теряют мать, отца, дом и любую надежду на светлое будущее — трагические последствия войны. Оставшиеся без родителей и убежища, Сейта и Сетсуко вынуждены бродить по сельской местности, страдая от голода и болезней. Встречаясь с безразличием взрослых во время своего пути, они понимают, что тяжёлые условия могут превратить даже самых нежных душ в жестокость. Тем не менее их юный оптимизм сияет против непреклонных трудностей, удерживая их от быстрого падения к неизбежной гибели и печальной памяти о жертвах родителей. Их путешествие становится свидетельством стойкости человеческого духа в условиях военной жестокости.