Прошел год с тех пор, как Широ, Серебряный Король, исчез; Куро Ятогами и Неко неустанно искали его, но безуспешно. Их расследование приводит их в конфликт с бывшими членами распавшегося Красного Клана HOMRA — Рикио Камамото и Анна Кушина, которые охотятся на них Зелёным Кланом, стремящимся захватить способности Анны для своих целей. В ответ Септер 4 присоединяется к Куро и Неко, чтобы спасти Анну, маскот и единственную выжившую женщину упавшего Красного Клана, от враждебных рук, при этом надеясь найти Широ через её юные силы. Среди волнений группа сталкивается с борьбой за власть, когда Зелёный Клан пытается захватить территорию Золотого Короля. Второй том саги K Project, K: Missing Kings, следует за молодым мальчиком, вовлечённым в психический конфликт среди семи монархов, подчёркивая испытания каждого персонажа после потери их суверенов.