ジョー・シマムラと彼の友人たちは普通の人々に見えるかもしれませんが、実際はそうではありません。実際、ジョーはサイボーグ009であり、人類の利益のために戦うエンジニアリングされた存在たちの一団のメンバーです。すべてのサイボーグは、どんな物質も溶かしたり、水中で呼吸したり、空を飛んだりするなど、独自の能力を持っています。彼と残りの8人はネオ・ブラックゴースト派閥によって強制的に改造され、彼らの目的を果たすように仕向けられました。しかし、彼らは団結し、自分たちの力を活かして元の奴隷主とすべての悪意ある勢力に対抗しました。彼らは今日も至る所で暴政に対して名誉を持って戦っています。
