現代日本で、13歳の安坂はじめは祖父と暮らすために田舎へ引っ越します。途中、戸惑いながら彼は『アーク』というカフェに迷い込み、そこで見事なサービススタッフ・桜山さよこ「嵐」に一瞬で惹かれます。最初は少年に無関心だった嵐ですが、彼の手を取った瞬間から態度が変わり、自分たちに絆があると確信します。嵐は普通のティーンエイジャーではないことがすぐに明らかになります。実際、彼女は第二次世界大戦で亡くなった少女の霊です。リンクしている男性に触れることで、彼女は過去へ戻ることができます。自分の力を発揮できる相手に出会えたことに喜び、嵐ははじめに協力を求めます。彼女の使命は、戦争で命を失った自分を救うために民間人を戦争の恐怖から救い出すことです。嵐に魅了されたはじめはためらうことなく同意します。しかし、彼女の歴史に深く関わるにつれ、二人は彼女が時間を旅する唯一の存在ではないことに気づきます。