Kannazuki no Miko разворачивается в Махоробе, деревне, где время мягко течет для людей и природы. Две ученицы знаменитой академии Ототачибана кажутся совершенно разными: Химеко, сдержанная и нерешительная; Чикане, уверенная и грациозная. Тем не менее их привязанность непоколебима, и ничто не может разорвать их связь несмотря на все препятствия.
В день, когда они отмечают общий день рождения, злой шёпот превращает одного из спутников в нападающего. Как только отчаяние достигает пика, угнетённые лунно‑солнечные способности жрицы внутри обеих девушек вспыхивают, высвобождая тьму. Это был лишь первый тест; теперь им предстоит столкнуться с бесчисленными угрозами, которые ставят под угрозу их существование — даже теми, кто находится рядом с ними. Их решимость укрепляется, создавая непроницаемый щит надежды, который противостоит каждому надвигающемуся опасности. Вместе они проходят сквозь тени, веря, что любовь осветит даже самые темные уголки.