В ближайшем будущем человечество начинает новую энергетическую революцию после открытия Фотонной энергии. Извлечённая из руды, добытой под склоном горы Фудзи, эта энергия обещает решить глобальные энергетические кризисы своей ошеломляющей мощностью. Поиск её привлекает Доктора Хела, тирана, желающего мирового господства, который возглавляет своих лейтенантов: барона Ашуру, графа Брокена и визконта Пигмана. Вместе они мобилизуют армию механизированных зверей, выкапываемых из древних греческих руин, чтобы захватить лабораторию Фотонной энергии. Противостоящим их нападению является импульсивный юноша Кабуто Кудзи, который управляет фотонным мехом, построенным его дедом, Мазингером Z. Однако в разгар схватки между Доктором Хелем и кланом Кабуто бесчисленные мифы эпохи Микенов и острова Бардо — а также скрытые истины за Мазингером Z — продолжают окутываться загадкой.
Новая серия, вдохновлённая пионерской меха-сагой Мазингер Z и названная Shin Mazinger Shōgeki! Z‑Hen, пересказывает историю с нуля с новыми персонажами, предлагая сюжет, оторванный от оригинальной серии.