Джоугору Кобато обычно втягивает себя в чужие проблемы. Поняв, что его детективные способности ни желательны, ни вознаграждаются, он объединяется с молчаливым другом Юки Осанай, чтобы сливаться с толпой. При входе в старшую школу их цель — казаться обычными в глазах одноклассников; однако Кобато не может устоять перед возвращением к инстинктам расследования, когда возникают обычные загадки, которые кажутся тривиальными, но вызывают замешательство. К сожалению, тривиальные события — не все, с чем они сталкиваются неожиданными способами. Путешествуя по школьной жизни и стремясь оставаться незаметными, Кобато и Осанай сохраняют низкий профиль и избегают сплетен, чтобы защитить свой секрет. Они иногда попадают в инциденты, которые тихо угрожают их тщательно выстроенному ежедневному распорядку.