ケーキへの深い愛情を抱くにもかかわらず、ぎこちない天野一歌はどんな試みでも成功を収めたことがありません。名高いパティシエ・ヘンリ・ルーカスとの偶然の出会いで、彼女の卓越した味覚が明らかになるものの、一歌自身はそれに気づいていません。ヘンリは彼女の可能性を感じ取り、スタ・マリーアカデミーという名門のデザート専門料理学校への入学を勧めます。経験が浅い初心者であるにもかかわらず、ヘンリの推薦により、一歌は「スイーツプリンス」と呼ばれるエリートクラスに迎えられます。これらの名高い菓子職人は、古典日本菓子の達人・安藤千之助、砂糖で花を作る専門家・花風五月、そして天才的なチョコレート職人・柏野誠です。彼らの「スイーツスピリット」と呼ばれる、パティシエの夢を叶える妖精たちとともに、一歌とプリンスたちは競争の激しい菓子界で野望を追い求めます。彼らは伝統と革新を融合させた壮大なプロジェクトに取り組み、創造性・精度・風味の調和を試す学校コンテストで競い合います。