ある日、輝く真紅の太陽が炎を失い、『崩壊現象』と呼ばれるものを引き起こした――春谷有田の村が破壊され、住民たちが消えてしまった。しかしすべてが失われたわけではない。幼馴染であり従兄弟の春谷ひじりが贈った魔法の書を手に、有田は人工的な手段で現実を再構築した。
この災厄を調査するため、リリス・アサミは有田に立ち向かい、彼の作り上げた世界が崩れ落ちる中で対峙する。彼女は厳しい選択肢を提示する――書を手放すか、死ぬか。 有田は拒否し、代わりに第三の道を選ぶ――秘密組織であるロイヤル・ビブリア学院に入学し、そこには他の六人の魔術師が待っている。リリスと共に、彼らは『トリニティ・セブン』となり、学校のエリートとしてそれぞれの能力を高める。
ひじりを救うという願いと新たな仲間の助けに駆られ、有田は愛する故郷を破壊から守り、最も親しい友人を取り戻すために何としても立ち向かう。
