年は天幕を横切る彗星の軌跡を示し、空を裂く。地球の深淵から影の神が再び覚醒する。やがて、闇に潜む悪しき力が地獄の底から立ち上り、我々の領域に現れる。風の刃の感情がサファイア光源で集まり、三つの剣が一つに融合し、闇を粉砕する。
1580年、織田信長の呪われた軍団が日本を無慈悲に進撃する。若い忍者は族の虐殺からかろうじて逃れ、影に溶け込む。彼女は霞流の唯一の生存者である彩芽で、彼女の短剣は三つの魔法の剣の一つだ。佐孔と龍馬――聖なる刃と槍を携えた反逆忍者らが加わり、彼らは腕と才能を合わせて『魔法の剣の予言』を実現するか、死に至るしかない。