2006年、東京県立呪術高校の廊下は、離れがたい仲間同士の終わりなき喧嘩と熱い議論で響いていた。揺るぎない自信を放つ五条悟と月斗は、彼らが代表する若くて強力な特殊格術者に匹敵する障害はないと確信していた。彼らの任務は、理知的な少女・天海リコを呪術界の核心を体現する存在へ安全に送り届けることだった。しかし、この任務は彼らを、術者と一般人の間にすでに緊張している脆弱な絆を粉砕する危険を孕む、容赦ない道徳的旋風へと引き込んでいった。
12年後、学生と術者は、人間の否定感情によって燃え上がる強力な呪いの急増に対抗する最前線として立ち上がっていた。これらの存在が強くなるにつれ、自己認識と野心も高まっていった。呪いは共通の目的を持ち集結する：人間を排除し、呪力だけで生きる世界を築くこと。古代の危険な精神に導かれ、呪力者だけが住む世界を作る。最大の脅威―最強術者五条悟―を排除するため、彼らはハロウィンに渋谷駅で攻撃を仕掛ける。小隊に分かれ、術者たちは戦いに臨み、無実の人々と自分たち自身を守るために何でも犠牲にする覚悟を決めていた。
