日本におけるテロ事件の件数は、Direct Attack(DA)という組織の活動のおかげで決して低下したことがありません。DAは孤児少女を「リコリス」計画のために殺し屋へと育て上げます。井上貴奈は、目的意識に駆られ完璧主義に没頭するトップリコリスとして際立っています。人質危機が彼女の忍耐を試し、結果的に反抗行動が起きることでDAからの転属を余儀なくされます。唯一知っていた家を失うことに不満を抱きながら、彼女は新しい拠点「LycoReco」へと不本意に向かいます。LycoRecoは普通のように見えるカフェです。
貴奈の新しいチームメイトは、彼女が期待していたものとは大きく異なります。リコリスの天才と称される西木城千里は、任務に対してほとんど関心を示しません。彼女は貴奈を奇妙な用事に連れ込み、必要としている人々を助けるためだと主張します。さらに千里が武装した攻撃者のギャングを殺さずに中和する場面で、貴奈は自分が外部者だと感じます。彼女はDAに戻りたいと思っていますが、千里は敵を排除するだけでは人生のすべてではないと主張します。カフェの壁には古い戦争遺物が並び、監視のざわめきが街を安全に保っています。貴奈の心は忠誠、アイデンティティ、そして自分がいつか所属できるのかという疑問でざわめいています。