В первом сезоне B: The Beginning два главных героя столкнулись со своей историей через глубокие жертвы. Маверик-детектив Кейт Флик боролся с внутренними демонами и в итоге раскрыл зловещие истины Королевства Кремоны. Бодрый мутант Коку наконец восстановил самый ценный фрагмент своего похищенного прошлого. Через несколько месяцев глобальная память, казалось, стерла потрясения, вызванные этими событиями. Пока Кейт вернулся в Королевскую полицию, чтобы расследовать личное дело, Коку и Юна стремились к спокойной рутинной жизни. Однако последствия испытаний Яула Бланка остаются сильными, когда Коку вскоре узнает о возвращении своего коллеги Кирисаме, которого считали мертвым. Их встреча заставляет их столкнуться с оставшимися тенями экспериментов, угрожая их хрупкому миру и заставляя город подготовиться к последствиям.
