После завершения турнира Koshien в школе Vanguard High School, Ко́жи Ибуки мучаются новыми кошмарами. Номе Татсунаги призывает Суйко в особняк, где они обнаруживают, что он может воспринимать Темную Башню, известную как Святилище. Башня искажает историю во времени, и единственный способ восстановить её — чтобы Ко́жи сначала исправил свою будущую ошибку. Поэтому Ко́жи и Суйко должны отправиться в параллельный мир — если возможно — и наблюдать, как Магические Девушки Эми Сендо и Шука призывают юниты Vanguard для восстановления истории. К сожалению, они не могут оказать значительного влияния на дело, поскольку карточные битвы с реальными монстрами оказываются в значительной степени неэффективными перед этой задачей.
