新隆私立アカデミーは裕福な生徒向けの高額校であり、貧困に苦しむ水銀陸（Suigin Riku）の姿は予想外だ。そんなエリートキャンパスに通いながらも、彼の限られた資金は就労を余儀なくしている。授業料を賄うために複数のアルバイトを掛け持ちしていないときは、彼はRPG『ダンジョンクレッセント』で時間を過ごし、そこでオンライン仲間と絆を築いている。ゲームが終了した際、水銀は彼の片思い相手である優しいレイリク（Rei Riku）と仮想の友人が実は同一人物であることを知る。
この衝撃の後、レイは『グレイブバスター』というダンジョンクレッセントの開発者が手掛けた新作オンラインゲームに誘拐され、彼はレイを救うために過酷なペイ・トゥ・ウィン環境へ飛び込むことになる。
『銀のガーディアン2ndシーズン』は、レイを救う水銀の使命と、この奇妙な世界の謎を解き明かす旅を描く。彼は危険な試練を乗り越え、隠された真実を明らかにしてレイを取り戻さなければならない。
