意識を取り戻した後、古川結衣はカレンダーに7月13日と記されていることを知り、これまで経験したことのない日だと悟る。しかし彼女は夏休みを、長島花宮の先祖が残した邸宅で天文部の他メンバーと過ごすことを選ぶ。そこは歴史ある住居で、長島の曾祖母が近隣の防衛工場で技術革新を先駆けた名誉ある科学者だった。部員たちがビーチへ出かけている最中、突如として嵐が襲い、計画は途中で終わる。選択肢がないため、彼らは廃工場の中に避難し、やがて隠された地下バンカーを発見する。中で彼らは、消えた未来と結びつく驚異的な証拠を見つけ、時間と運命に対する理解を再構築し、今日まで想像もしなかった運命へと導くかもしれない。
