物語は近未来に展開し、人類が軌道エレベーターの建設を完了させ、宇宙の広大な空間で外惑星を積極的に探査している時代です。『オブリクス』と呼ばれる神秘的な異星人脅威が我々の太陽系を標的にし、人類は各国を超えて最初に出会う外来種との戦争へと追い込まれます。敵の優れた技術に対抗するため、クロノス財団は日本の宮本武蔵と坂本龍馬からフランスのナポレオン・ジャンヌ・ダルクまで、すべての文化にわたる国民英雄の子孫を集めます。そして、財団はこれらの血統とギア戦闘スーツを融合させ、クロノス・ギアという強力な生物兵器を創造し、人類を異星人脅威から守ります。
