カントーでは、第一シーズンの出来事の後に嵐前の静寂が広がっているが、誰もそれが長くは続かないことを理解している。第二シーズンでは、三つの学校が主役となり、それぞれのリーダーに潜伏したドラゴンが眠っている――彼らこそが致命的な戦いで勝者を決めるべき存在だ。キョウソのリーダー、モトク・ソソは影から姿を現し、急速に自らの勢力を固め、周囲を支配し、反抗者には容赦なく罰を与えている。彼に立ち向かえるのはセイトとナンオの二つのアカデミーだけだが、彼らには強力な戦士だけでなく内部の問題も抱えている。最初のアカデミーのリーダー、ドラゴンの血を受け継いだリュウビ・ゲントクは、読書好きで暴力に反対する臆病な少女。第二のアカデミーのリーダー、第一シーズンから知り合いになったソンサク・ハクフは、強く勇敢な少女だが「王者の頭脳」さえ持たない。忠実な友人と賢明な師が両者を完全に力を解放させることができるかは、時間だけが示す。さらに、勝利の鍵は「ドラゴン緑玉」という謎のアーティファクトにあるかもしれないことが判明する。三国志の歴史を繰り返しながら、シリーズの登場人物は中国第二世紀の最もドラマチックな出来事――赤壁の戦いを再現し、何度も自らの運命を変えられるかという問いに挑む。