超自然災害防止機関は、政府によって設立され、霊と戦うために作られた。ミディアム、透視者、除霊師、奇妙な能力と風変わりな外見を持つ人々は、自らの命を危険にさらしながら、魔法の剣や聖水入りピストルからバイクや飛行機に至るまで、最も信じがたい装備を使って悪と闘う。
しかし初めの二話の血まみれの雰囲気と狂ったドライブにもかかわらず、Ga-Rei Zero の主要な出来事は危険なモンスターを追跡し破壊することだけではない。
このシリーズの主なヒロインは除霊師一家の相続人である二人の少女だ。長女の伊佐山 よみは思いやりのある姉として成長し、若い津土 カグラの母親を大部分で代わりに務めた。カグラの父は娘に時間を割く余裕がなく、よみとカグラはいつも一緒だった – 学校の後や家で、任務中でも。彼女たちの生活は霊と戦う以外にも幸せな瞬間や悲しい瞬間、日常の喜びと哀しみが多くあった。仲間たちは『妹』たちが並んで難しい仕事をこなすことに慣れており、誰もよみがカグラに剣を振るうとは想像できなかった…
