「Seiken Tsukai no World Break」は赤羽私立学院で展開され、過去の存在を覚えている生徒たちが、警告なしに襲い来るモンスター「メタフィジカル」から守るために祖先の術を使うことを教えられる。救い主と呼ばれるこれらの生徒は、プラーナをチャネルして鋭い武器を召喚する「黒金」と、魔法を操る「黒麻」に分けられる。黒金は物理攻撃に重点を置き、黒麻は防御呪文で優れている。
物語はシリーズの重要なクライマックスから6か月前、学年初めの開会式を舞台に始まる。イベントが終わった後、主人公の摩羅羽海村は「蘭上咲月」という少女に出会い、彼女が以前の転生で摩羅羽の妹だったと告げられ、彼自身は剣で全軍を討ち取る勇敢な王子だったと語られる。すぐ後に、彼は別の青年「漆原静乃」に会い、彼女もまた異なる前世で摩羅羽を知っており、その時彼は破壊的な魔術を使う暴君であったが、彼女を奴隷状態から救い出したと告白する。現在と過去の意識を橋渡しできる人々は、本当に輝かしい運命を築けるのだろうか？「Seiken Tsukai no World Break」の複雑な世界に没頭し、物語が展開する中で同盟が結ばれ、隠された力が覚醒し、すべての信念に挑戦する様子を発見してみよう。
